Biólogo usa base de datos del genoma para investigar células cancerosas
Investigadores de la Universidad Estatal de Florida están contribuyendo a la Enciclopedia de elementos de ADN, un proyecto para comprender mejor cómo funciona el genoma humano. Crédito: Institutos Nacionales de Salud.
El profesor de Ciencias Biológicas de la Universidad Estatal de Florida, David Gilbert, utiliza la información más reciente sobre el genoma humano como guía para comprender mejor el cáncer.
Gilbert y sus colegas de FSU formaron parte de un equipo que comparó diferentes tipos de células cancerosas con una base de datos de células humanas normales utilizando un nuevo método que desarrolló que puede identificar el tipo de célula del que derivan los cánceres. Al comparar varias células cancerosas con la colección de células normales, pudieron determinar qué cánceres coincidían en su mayoría con diferentes tipos de células.
«Las células cancerosas provienen de una célula en su cuerpo, pero han cambiado». dijo Gilberto. «Saber de qué tipo de células provienen es particularmente importante al evaluar si un tumor nuevo en un paciente con recaída se deriva del tumor original o es un cáncer completamente nuevo».
Su trabajo, publicado en Nature Communications, es una pieza complementaria de una gran serie de publicaciones resultantes de un esfuerzo internacional para comprender cómo funciona el genoma humano, financiado por los Institutos Nacionales de Salud, llamada Enciclopedia de Elementos de ADN (ENCODE). Debido a que solo el 1 por ciento del ADN humano codifica alguna proteína conocida, comprender la función del resto de nuestro genoma ha sido un gran desafío.
Gilbert y sus colegas también contribuyen a la publicación ENCODE más grande, publicada en Naturaleza, que resume los esfuerzos del último ciclo de financiación de ENCODE. Lo más destacado de este estudio es el mapeo de casi un millón de elementos en el genoma humano, que cubre el 8 por ciento del genoma, que regulan los genes. Es decir, determinan cuánto y en qué tejido corporal se expresará un gen.
«La complejidad de un organismo no está en la cantidad de genes que codifican proteínas que tiene», dijo Gilbert. «Está en la combinación de esos genes. Tenemos casi la misma cantidad de genes que los gusanos y las moscas, pero los expresamos en combinaciones más complejas».
Su laboratorio agrega la replicación, el proceso de hacer una copia del ADN. de sí mismo a la imagen.
«La gente a menudo no piensa en la replicación como algo que se regularía de manera diferente en diferentes tipos de células porque el ADN es el mismo en todas las células», dijo. «Sin embargo, no es solo el ADN el que se replica. Más bien, todos los componentes de los cromosomas que regulan el ADN se desmantelan por completo y se vuelven a ensamblar cuando el ADN se replica. Hemos demostrado que el orden en que se replican los segmentos de ADN es exclusivo de cada célula. tipo y también diferente en las células enfermas. Incluso puede ser único para el cáncer de un paciente específico».
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ENCODE3: Interpretación de los genomas humano y de ratón Más información: Jing Zhang et al, An integrative ENCODE resource for cancer genomics, Nature Communications (2020). DOI: 10.1038/s41467-020-14743-w Información de la revista: Nature Communications
Proporcionado por Florida State University Cita: Biólogo usa base de datos del genoma para investigar células cancerosas ( 2020, 29 de julio) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-07-biologist-genome-database-cancer-cells.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.