Estudio muestra conexión entre la ascendencia y la composición molecular de la célula cancerosa
Célula cancerosa durante la división celular. Crédito: Institutos Nacionales de Salud
Las preguntas sobre la impronta genealógica de los tumores se han cernido sobre la investigación del cáncer desde la finalización del Proyecto Genoma Humano en 2003. ¿Es el cáncer de hígado diferente en un nivel molecular básico en las personas de ascendencia africana que en las personas de ascendencia africana? ¿Descendencia europea? ¿El cáncer de mama tiene un perfil genético diferente en los asiáticos orientales que en los nativos americanos?
Un nuevo artículo de investigadores de la Red de Análisis del Genoma del Cáncer del NCI, un grupo colaborativo con investigadores de EE. UU., Canadá y Europa, proporciona la visión más completa hasta la fecha del efecto de la ascendencia en la composición molecular de los tejidos normales y cancerosos. . Basándose en datos de The Cancer Genome Atlas (TCGA) que involucraba a 10 678 pacientes y 33 tipos de cáncer, los investigadores encontraron que la ascendencia estaba vinculada a variaciones en cientos de genes, pero que la más importante de estas diferencias estaba vinculada a tipos de tejido específicos. El estudio se publica hoy en línea por Cancer Cell.
«Descubrimos que en pacientes de diferentes ancestros, las características moleculares correspondientes a esas diferencias se limitaban en gran medida a órganos y tipos de tejidos específicos», dijo Rameen Beroukhim, MD, Ph.D., de Dana-Farber y el Instituto Broad, coautor principal del estudio con Andrew Cherniack, Ph.D., líder de grupo en Dana-Farber y el Instituto Broad. «Esto sugiere que el seguimiento de los efectos moleculares de la ascendencia tanto en el tejido normal como en el canceroso debe adoptar un enfoque tejido por tejido».
Entre los hallazgos específicos de los investigadores:
- Desde un punto de vista molecular, las personas de ascendencia africana tienden a tener un tipo diferente de cáncer de riñón que las personas de ascendencia europea. La variedad africana se caracteriza con menos frecuencia por mutaciones que desactivan el gen VHL, lo que estimula el crecimiento de nuevos vasos sanguíneos para los tumores.
- Los cánceres de vejiga en personas de origen asiático oriental muestran menos signos de provocar una respuesta del sistema inmunitario que tumores de vejiga en personas de origen europeo.
En el estudio, los investigadores utilizaron una variedad de técnicas moleculares para determinar la ascendencia de los pacientes cuyas muestras de tejido se analizaron. Los pacientes se clasificaron principalmente como descendientes de europeos, asiáticos orientales, africanos, nativos/latinoamericanos o del sur de Asia. Los pacientes cuya ascendencia era al menos un 20% mixta se clasificaron como descendientes mixtos. (Estos pacientes se subcategorizaron por su ascendencia primaria, como africano-mezclado, europeo-mezclado, etc.). Como grupo, los pacientes tenían 33 tipos de cáncer, 13 de los cuales se dividieron en subtipos.
TCGA había realizado un análisis profundo del tejido de cada paciente, analizando células cancerosas y normales para una variedad de características moleculares. Estos incluían mutaciones (secciones de ADN mal copiadas); patrones de metilación del ADN (un proceso que influye en si los genes se activan o desactivan); ARN mensajero (una molécula que lleva una versión transcrita de ADN y es indicativa de actividad génica); y microARN (una forma de ARN que ayuda o dificulta la actividad génica). Los investigadores de la Red de Análisis del Genoma del Cáncer del NCI usaron estos datos para ver si las diferencias en cualquiera de estas características reflejaban diferencias en la ascendencia.
«Encontramos que las diferencias asociadas con la ascendencia abarcaban todas estas características y estaban presentes en cientos de genes diferentes», afirmó Cherniack. «Sin embargo, resultó que las diferencias más significativas, las que afectan la forma en que las células funcionan e interactúan con el resto del cuerpo, eran profundamente específicas de los tejidos». Aunque la ascendencia afectó las características moleculares en la mayoría de los tipos de cáncer, estos efectos no se compartieron entre los tipos de cáncer. Las diferencias moleculares en los cánceres de pulmón que se atribuían a la ascendencia africana, por ejemplo, no se encontraron en los cánceres de mama, páncreas u otros.
Los datos también permitieron a los investigadores preguntarse si las características relacionadas con la ascendencia de las células normales transferido a las versiones cancerosas de esas células, ya sea que las particularidades moleculares de las células pulmonares en personas de origen europeo, por ejemplo, también se encuentren en las células de cáncer de pulmón de tales individuos. Descubrieron que este era abrumadoramente el caso. «La mayoría de las diferencias en los tejidos normales de las personas con ancestros específicos se recapitulan en el cáncer», afirmó Beroukhim. Además, la evidencia sugiere que algunas de estas diferencias pueden contribuir al desarrollo de ciertos tipos de cáncer en personas con antecedentes similares.
Tener acceso a datos de pacientes de linaje mixto resultó ser una ventaja, dicen los autores del estudio. Los investigadores realizaron su análisis inicial en pacientes cuya ascendencia era al menos el 80 % dentro de uno de los cinco grupos genealógicos. Siguieron esto con un análisis similar de los datos de las poblaciones mixtas. «Cuando los resultados de los dos análisis coincidieron cuando las diferencias moleculares específicas de un grupo ancestral también aparecen en pacientes cuya ascendencia es una combinación de ese grupo y otros, fue una evidencia particularmente sólida de la validez del hallazgo original». dijo uno de los coautores principales del estudio, Jian Carrot-Zhang, Ph.D., investigador postdoctoral del grupo Meyerson en Dana-Farber and the Broad. «Los pacientes de antecedentes mixtos fueron un grupo particularmente poderoso para estudiar los efectos moleculares de la ascendencia en el cáncer», afirmó Beroukhim. «Nos ayudó a reducir qué regiones del genoma contribuyen a estas diferencias».
La naturaleza integral del estudio reveló algunas de las deficiencias de los esfuerzos anteriores para vincular el origen étnico y la ascendencia con los elementos moleculares de las células. Por un lado, esos estudios tendían a agrupar varios subtipos de cáncer, dijo Beroukhim, a pesar de que ciertos subtipos son más comunes en ciertos ancestros que en otros. Algunas de las técnicas utilizadas para diseccionar las características moleculares también pueden haber distorsionado los resultados de estudios anteriores.
Los investigadores aún tienen que determinar si las diferencias moleculares entre los ancestros son el resultado de factores ambientales o factores genéticos. Sin embargo, sí identificaron diferencias genéticas entre ascendencias que podrían explicar muchos de sus hallazgos.
«Nuestros hallazgos apuntan a la necesidad de más muestras de diversas ascendencias para realizar un análisis de ascendencia verdaderamente completo, especialmente de tejidos normales, Berukhim comenta. «Este estudio representa un paso importante en esa dirección».
Explore más
La ascendencia indígena estadounidense puede estar asociada con el cáncer de mama HER2 positivo Información de la revista: Cancer Cell
Proporcionado por el Instituto del Cáncer Dana-Farber Cita: El estudio muestra la conexión entre la ascendencia y la composición molecular del cáncer (11 de mayo de 2020) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020-05-ancestry-molecular-makeup-cancer.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.