La prueba universal de COVID basada en la amplificación isotérmica puede detectar todas las variantes de COVID-19
Esquema de cebadores LAMP: cebador externo F3forward; 3 imprimación exterior hacia atrás; imprimación interior FIPforward; imprimación interior BIPbackward; Cebador directo LFPloop, cebador regresivo LBPloop. Crédito: DOI: 10.1134/S0003683821080032
Investigadores rusos han desarrollado una estrategia para crear una prueba de COVID-19 barata y rápida basada en amplificación isotérmica. Según su publicación en Applied Biochemistry and Microbiology, el uso de esta estrategia permitirá crear sistemas de prueba universales para cualquiera de las variantes de COVID-19.
Hay varias opciones para los sistemas que detectan rastros de SARS-CoV-2 en muestras de sangre o secreciones humanas. Por lo general, detectan fragmentos del ARN patógeno de COVID-19 mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y sus análogos, o anticuerpos contra COVID-19.
Por lo general, se requiere bastante tiempo para una prueba de este tipo, de 30 minutos a varias horas, razón por la cual los investigadores están buscando métodos nuevos y más rápidos para detectar anticuerpos o infección por COVID.
Julia Makarova, profesora asociada de la Facultad de Biología y Biotecnología de HSE, está trabajando con ella colegas en otra alternativa a las pruebas de PCR que se basa en la llamada amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP). Este enfoque de prueba permite la multiplicación de ciertos fragmentos de ADN o ARN de muestras biológicas con el uso de marcadores especiales y fermentos de bacterias extremófilas que residen en aguas termales.
La ventaja clave de LAMP sobre PCR es que todas las reacciones Se puede hacer a la misma temperatura. Esto simplifica y acelera el proceso. Pero estos sistemas son mucho más complicados de desarrollar y tienen algunos inconvenientes, lo que anteriormente ha limitado su uso en los sistemas de prueba de COVID-19.
Los investigadores rusos desarrollaron una estrategia que ayudará a superar estos inconvenientes y brindar atención médica profesionales la oportunidad de utilizar las pruebas LAMP para detectar rastros de cualquier variante de COVID en muestras de moco y sangre sin un procesamiento preliminar en un laboratorio.
Según la Dra. Makarova, esto reducirá el costo de las pruebas de COVID-19 considerablemente y acelerar el proceso, ya que no se necesitarán profesionales especialmente capacitados ni equipos costosos.
«El virus muta bastante rápido y los sistemas de prueba que se crearon hace un año pueden no ser tan efectivos como solía ser. Analizamos las mutaciones y estamos buscando las partes más estables del genoma del virus. Esto ayudará a crear sistemas de prueba que reconozcan todas las variantes existentes y, lo que es más importante, las nuevas variantes que están apareciendo», dijo Julia Makarova, asso profesor asociado en la Facultad de Biología y Biotecnología de HSE.
Para resolver este desafío, los biólogos de HSE están buscando partes del genoma del coronavirus que no cambien mucho con el tiempo. Servirán como marcadores que los fermentos de bacterias utilizarán para convertir el ARN de COVID en ADN y multiplicarlo aún más. Combinados con los componentes del sistema LAMP existente, ayudarán a crear un sistema de prueba universal COVID-19, que podrá detectar rápidamente rastros de cualquier variante de COVID, concluyeron los investigadores.
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Nueva prueba de COVID con una precisión superior al 99 % Más información: JA Makarova et al, Amplificación isotérmica mediada por bucle como método prometedor para el diagnóstico masivo de COVID-19, Bioquímica aplicada y Microbiología (2021). DOI: 10.1134/S0003683821080032 Proporcionado por la Escuela Superior de Economía de la Universidad Nacional de Investigación Cita: La prueba universal de COVID basada en amplificación isotérmica puede detectar todas las variantes de COVID-19 (29 de diciembre de 2021) consultado el 29 de agosto de 2022 en https: //medicalxpress.com/news/2021-12-universal-based-isothermal-amplification.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.