Las bacterias ‘amigables’ pueden afectar la gravedad de la COVID-19
Los colaboradores del estudio del microbioma de la COVID-19 incluyen (primera fila, de izquierda a derecha) Julie Bastarache, MD, Meghan Shilts, MS, MHS, (fila central, de izquierda a derecha) Jodell Jackson, Ph. .D., Suman Das, Ph.D., Angela Jones, MS, (fila de atrás, desde la izquierda) Jonathan Schmitz, Ph.D., MD, Simon Mallal, MBBS y Jordan Best, Ph.D. Crédito: Donn Jones
Los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de EE. UU. otorgaron al Centro Médico de la Universidad de Vanderbilt un contrato de dos años y $3,7 millones para determinar los factores genéticos y bacterianos que pueden aumentar el riesgo de enfermedad grave y muerte por COVID-19.
La investigación «multiómica» determinará cómo la gravedad de la enfermedad de COVID-19 puede verse afectada por la composición genética de los pacientes y por las bacterias que viven en sus vías respiratorias, su «microbioma respiratorio».
En un artículo publicado el mes pasado, los investigadores de VUMC informaron que el virus COVID-19, SARS-CoV-2, interactúa con las bacterias respiratorias de maneras que pueden empeorar los síntomas.
El proyecto financiado por los CDC también genotipificar o determinar la secuencia genética del SARS-CoV-2 aislado de hisopos nasales recolectados de 5000 pacientes infectados en VUMC para determinar la presencia de cualquier variante de COVID-19.
Los investigadores esperan que al comprender estos factores que interactúan, podrán predecir qué pacientes tienen probabilidades de enfermarse gravemente o no responder a los tratamientos antivirales, incluida la terapia con anticuerpos. El objetivo final es traducir un diagnóstico mejorado en tratamientos más efectivos y mejores resultados.
VUMC está en una posición única para hacer este tipo de investigación debido a la profundidad de sus recursos en genómica, virología y enfermedades infecciosas, dijo Suman. Das, Ph.D., profesor asociado de Medicina.
Das y Jonathan Schmitz, MD, Ph.D., director médico del Laboratorio de Enfermedades Infecciosas Moleculares, son los co-investigadores principales del proyecto. Simon Mallal, MBBS, director científico de los núcleos VANTAGE (VUMC Technologies for Advanced Genomics) e IMGSCT (Immunogenomics, Microbial Genetics and Single Cell Technology), es co-investigador.
Los recursos clave incluyen BioVU, el enorme biobanco de más de 400.000 muestras individuales de ADN y otros materiales biológicos.
BioVU está vinculado a un «derivado sintético», registros de salud electrónicos a los que se les ha quitado la información de identificación y que permiten a los investigadores estudiar las diferencias en la composición genética de pacientes con enfermedades específicas, incluido el COVID-19.
Otro recurso es MicroVU, que tiene especímenes biobancos que contienen más de 200 especies diferentes de bacterias vinculadas al almacén de datos de investigación de VUMC. Codirigido por Schmitz y Maria Hadjifrangiskou, Ph.D., y administrado por el Instituto de Investigación Clínica de Vanderbilt (VICTR), el recurso incluye muestras respiratorias de pacientes con COVID-19.
El núcleo VANTAGE llevará a cabo secuenciación de alto rendimiento del genoma viral para determinar la presencia de variantes, y el núcleo IMGSCT realizará la tipificación HLA y otras inmunogenómicas, dijo Mallal.
Das y colegas, incluido Christian Rosas-Salazar, MD, MPH , han estudiado las interacciones entre los virus respiratorios y el microbioma durante varios años.
En 2018, informaron que los bebés que tienen cantidades más altas de la bacteria «amistosa» Lactobacillus presente en la nariz o en la parte superior de la garganta durante una infección aguda por el virus respiratorio sincitial (RSV) tienen menos probabilidades de desarrollar sibilancias infantiles más adelante en la vida.
En el estudio publicado en el Journal of Allergy and Clinical Immunology, los investigadores informaron que la infección por SARS-CoV-2 y su carga viral, cuanto el virus está presente, afecta la abundancia de múltiples bacterias en las vías respiratorias.
«Estas bacterias pueden ser importantes para modular la forma en que responde al virus en sí», dijo Rosas-Salazar, profesora asistente de Pediatría y directora del artículo. Primer autor. «Sabemos muy poco de los factores de riesgo de los resultados en COVID-19, por lo que comprender estas interacciones virales y bacterianas puede ser clave para predecir la gravedad».
Explore más
Un estudio encuentra pistas genéticas sobre el riesgo de neumonía y las disparidades de COVID-19 Más información: Christian Rosas-Salazar et al. La infección por SARS-CoV-2 y la carga viral están asociadas con el microbioma del tracto respiratorio superior, Journal of Allergy and Clinical Immunology (2021). DOI: 10.1016/j.jaci.2021.02.001 Información de la revista: Journal of Allergy and Clinical Immunology
Proporcionado por la Universidad de Vanderbilt Cita: Las bacterias «amigables» pueden afectar Gravedad de COVID (2021, 12 de marzo) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-03-friendly-bacteria-impact-covid-severity.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.