Modelo de aprendizaje automático encuentra riesgos de COVID-19 para pacientes con cáncer
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Si un paciente con cáncer da positivo por COVID-19, ¿es más probable que sea hospitalizado por la enfermedad?
Eso depende de ciertos factores de riesgo, según un nuevo estudio realizado por investigadores del Laboratorio Nacional Lawrence Livermore (LLNL) y la Universidad de California, San Francisco (UCSF), que buscaron identificar los riesgos relacionados con el cáncer para los malos resultados de COVID -19. Al analizar una de las bases de datos más grandes de pacientes con cáncer y COVID-19, el equipo encontró vínculos no informados previamente entre un tipo raro de cáncer, así como dos medicamentos relacionados con el tratamiento del cáncer y un mayor riesgo de hospitalización por COVID-19. Los hallazgos aparecen en la revista Cancer Medicine.
«Todavía hay mucho temor sobre cuáles son los impactos en el riesgo de los pacientes con cáncer y COVID-19», dijo el investigador principal del LLNL, Priyadip Ray. «La clave de este estudio fue la solidez del conjunto de datos, que nos permitió observar este sector de nicho y fue lo suficientemente grande como para encontrar algunas perspectivas estadísticamente significativas relacionadas con el cáncer y la medicina. Estos son elementos potencialmente procesables para que los médicos dejen que sus los pacientes sean más conscientes, tomen más precauciones o incluso busquen tratamientos alternativos».
Usando un enfoque de regresión logística, el equipo examinó datos anonimizados del Registro de Salud Electrónico (EHR, por sus siglas en inglés) del Conjunto de Datos de Investigación COVID de UC Health (UC CORDS) en casi medio millón de pacientes que se sometieron a pruebas de COVID-19 en los 17 hospitales afiliados a la UC. El conjunto de datos incluía a casi 50 000 pacientes con cáncer, más de 17 000 de los cuales también habían dado positivo por COVID y contenía información sobre la demografía de los pacientes, comorbilidades, análisis de laboratorio, tipos de cáncer y diversas terapias contra el cáncer.
Los investigadores examinaron una variedad de factores y los resultados de la enfermedad, incluida la hospitalización, la ventilación y la muerte, e identificó un mayor riesgo de COVID-19 debido a un grupo específico de cánceres de sangre más raros y dos medicamentos utilizados para tratar el cáncer: venetoclax (utilizado para tratar la leucemia) y metotrexato (un inmunosupresor utilizados en quimioterapia).
«Descubrimos que los pacientes con cánceres llamados neoplasmas mieloproliferativos o que reciben tratamientos anticancerígenos específicos pueden tener más probabilidades de ser hospitalizados después de una infección por SARS-CoV-2», dijo el colaborador Daniel Kwon, profesor clínico asistente en la división de hematología/oncología del Departamento de Medicina de la UCSF. «Hasta donde sabemos, este es el primer estudio que identifica estos posibles factores de riesgo. Se necesitan más estudios en estas poblaciones».
El científico informático de LLNL, José Cadena, trabajó con los coautores Sam Nguyen y el ex graduado académico de LLNL. designado Ryan Chan (actualmente estudiante de doctorado en la Universidad Johns Hopkins) sobre las herramientas de software para extraer y analizar los datos almacenados en el sistema UCSF. Dijo que tener acceso a una base de datos tan grande con el historial médico detallado de cada paciente fue clave para el estudio.
«Nos permite evaluar el riesgo potencial de muchos factores diferentes con cierta confianza razonable de que los hallazgos son estadísticamente significativa y relevante para una población más allá de la cohorte suplente», dijo Cadena. «Una de las razones por las que me uní a LLNL fue para realizar investigaciones que podrían tener un impacto nacional o mundial. Sería fantástico si nuestros hallazgos ayudaran a los médicos a mejorar la atención de los pacientes con cáncer con COVID».
Además del cáncer -riesgos específicos, el estudio examinó si las personas con cáncer tienen un mayor riesgo de infectarse con COVID-19. En contraste con estudios previos, el equipo encontró que los pacientes con cáncer entre la cohorte de UC tenían menos probabilidades de contraer COVID-19 que la población general, lo que, según la hipótesis, podría estar relacionado con que los pacientes con cáncer tengan más probabilidades de tomar precauciones para disminuir la transmisión (p. ej., distanciamiento social y uso de máscaras), prácticas de prueba frecuentes y tener umbrales más bajos para someterse a pruebas en comparación con pacientes con cáncer en otras regiones.
Cadena dijo que tales hallazgos contradictorios resaltan uno de los desafíos de usar EHR para modelar enfermedades , donde hay «numerosos factores de confusión que confunden el análisis y deben tenerse en cuenta». Los investigadores dijeron que se necesita más investigación para ayudar a explicar y confirmar el menor riesgo de positividad de la prueba COVID-19 en pacientes con cáncer.
El equipo encontró factores de riesgo adicionales para COVID-19 que se informaron anteriormente, como etnias asiáticas e hispanas/latinas (que constituían el 36 por ciento de los pacientes con cáncer positivos para COVID) y comorbilidades como la vejez, la enfermedad de las arterias coronarias, la enfermedad renal crónica, la diabetes mellitus y la enfermedad pulmonar obstructiva crónica, que se asociaron con un mayor riesgo de hospitalización y enfermedad más grave.
El trabajo es parte de un estudio piloto, y los investigadores están buscando financiación externa para un examen más detallado. Ray dijo que al equipo le gustaría agregar datos genómicos y de imágenes variables en el tiempo y aplicar una IA más sofisticada y otras herramientas para encontrar mejores formas de tratar a los pacientes. En el futuro, esperan comprender no solo la mecánica de la enfermedad, sino también cómo los factores socioeconómicos, como los ingresos y los seguros, pueden desempeñar un papel.
«Todos nosotros estamos muy emocionados», dijo Ray. «Cuando investigas, no siempre ves cosas que se puedan traducir de inmediato. El potencial de que puedas impactar de inmediato en la forma en que tratas una enfermedad, atiendes a los pacientes o brindas orientación a los pacientes o médicos sobre cómo pueden manejar su enfermedad, es muy satisfactorio».
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Las personas hospitalizadas con cáncer activo tienen más probabilidades de morir a causa de la COVID-19 Más información: Daniel H. Kwon et al, Resultados de la COVID-19 en pacientes con cáncer: Hallazgos de la Base de datos del sistema de salud de la Universidad de California, Medicina del cáncer (2022). DOI: 10.1002/cam4.4604 Información de la revista: Cancer Medicine
Proporcionado por el Laboratorio Nacional Lawrence Livermore Cita: El modelo de aprendizaje automático encuentra los riesgos de COVID-19 para los pacientes con cáncer ( 2022, 10 de marzo) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-03-machine-covid-cancer-patients.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.