Nuevo método de muestreo de tumores mejora significativamente las pruebas genéticas para el tratamiento del cáncer

Ilustración que establece el método de secuenciación representativo. Crédito: Roche

Investigadores de Crick, Roche y The Royal Marsden NHS han desarrollado un método holístico de muestreo de tumores que detecta con mayor precisión las alteraciones genéticas en los tumores, que son fundamentales para permitir que el tratamiento se personalice para todos y cada uno de los pacientes. Foundation Trust y publicado en Cell Reports.

Hoy en día, para ayudar a los médicos a seleccionar opciones de tratamiento para pacientes con cáncer, se puede secuenciar el ADN de una muestra de su tumor. Su objetivo es encontrar mutaciones en el ADN que indiquen que el tumor es susceptible o resistente a un tratamiento específico. Por lo tanto, los resultados de esta prueba tienen un impacto significativo en las opciones de tratamiento y el pronóstico del paciente.

Sin embargo, la genética de los tumores es compleja porque a menudo están formados por diferentes grupos de células que varían genéticamente y se ubican en diferentes partes del tumor.

Los métodos de muestreo actuales pueden pasar por alto esta diversidad genética porque usan tejido tomado de una sola ubicación pequeña en el tumor. En la práctica rutinaria, en promedio, solo se analizan cinco en un millón de células del tumor (0,0005%). Esto significa que los médicos toman decisiones de tratamiento basadas en información potencialmente incompleta, lo que puede llevar a que los pacientes se pierdan las terapias que les darían las mayores posibilidades de supervivencia.

Inicialmente, el concepto de muestreo mejorado fue probado en cánceres de pulmón y vejiga, donde una simulación de muestreo mejorado redujo las tasas de clasificación errónea al decidir si un paciente era apto para la inmunoterapia del 20 % al 2 % y del 52 % al 4 % respectivamente, en comparación con los métodos actuales.

Basándose en este hallazgo, desarrollaron una técnica llamada secuenciación representativa, que crea una imagen más precisa del ADN de un tumor. Esto funciona tomando la mayor parte del tumor extirpado en la cirugía (tejido que no se muestrea actualmente y que se descarta de forma rutinaria) y mezclándolo para que las células de diferentes áreas del tumor se distribuyan de manera más uniforme. Luego se toma una muestra de esta mezcla para secuenciar el ADN.

Los investigadores probaron este nuevo método en 12 pacientes con cáncer de riñón, mama, colon, pulmón o piel. Al comparar los métodos nuevos con los actuales, descubrieron que la secuenciación representativa brindaba resultados mucho más consistentes, ya que evita el sesgo de observar solo una pequeña parte del tejido tumoral. En cambio, el nuevo método es capaz de capturar información de una representación bien mezclada de todo el tumor, lo que significa que se recopilan muchos más datos que también son de mejor calidad. Como analogía, la nueva prueba tiene un punto de vista más alto y se parece más a una búsqueda policial usando un helicóptero, en lugar de rastrear a un criminal solo desde un lugar en el suelo.

El método, que fue desarrollado en colaboración con investigadores de Crick, Roche Diagnostics y The Royal Marsden y publicado en Cell Reports se está probando más en 500 tumores en The Royal Marsden en Londres para establecer aún más su viabilidad y utilidad. Los investigadores esperan que, luego de los resultados exitosos, se siga implementando.

«Al brindar a los médicos información más precisa sobre un tumor, esperamos que nuestro método conduzca a que los pacientes y los tratamientos coincidan significativamente mejor». Además, existe la oportunidad de obtener conocimientos biológicos críticos al aumentar el espacio de búsqueda dentro de cada tumor», dice Samra Turajlic, líder de grupo en Crick and Consultant Medical Oncologist en The Royal Marsden.

A través de una amplia En una prueba en un caso de cáncer de riñón, el método de muestreo representativo arrojó resultados genéticos idénticos el 95 % de las veces, en comparación con solo el 77 % de consistencia con los métodos actuales. De manera similar, en un caso de cáncer de piel, el nuevo método identificó correctamente un cáncer altamente complejo y difícil de tratar desde el principio, mientras que el método actual no detectó información genética importante.

«Este método es más preciso, tiene más resultados reproducibles y tiene el mismo costo de secuenciación que la técnica actual. De hecho, al introducir un paso de purificación adicional y simple, podría volverse mucho más económico que el proceso existente. Podría cambiar las reglas del juego para la toma de muestras de tumores en hospitales y en investigación». dice Kevin Litchfield, autor principal y bioinformático en el Laboratorio de Terapéutica del Cáncer Traslacional en Crick.

«A través de este trabajo, hemos abordado un obstáculo importante para el diagnóstico de tumores sólidos mediante un método sencillo que se puede implementar en la clínica», dice Nelson Alexander, investigador principal del proyecto en Roche Molecular Solutions. «Es una gran demostración del impacto que pueden tener las colaboraciones entre instituciones públicas y privadas. superar los desafíos de larga data en el cuidado de la salud».

El profesor David Cunningham, director de investigación clínica de The Royal Marsden, dijo: «La selección de pacientes que se beneficiarán de las terapias contra el cáncer sigue siendo un desafío importante; -Control tumoral duradero mientras que otros pacientes pueden sufrir efectos secundarios pero sin beneficio. Esta simple pero ingeniosa revisión de una técnica establecida para analizar el ADN tumoral debería facilitar un enfoque más personalizado para el tratamiento de pacientes con cáncer». strong>Más información: Cell Reports (2020).DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107550 Información de la revista: Cell Reports

Proporcionado por The Francis Crick Institute Cita : Nuevo método de muestreo de tumores mejora significativamente las pruebas genéticas para el tratamiento del cáncer (5 de mayo de 2020) consultado el 31 de agosto de 2022 en https://medicalxpress.com/news/2020-05-tumour-sampling-method-significantly-genetic .html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.