Primer estudio de múltiples genomas completos de la EII en afroamericanos
En los afroamericanos, el panorama de riesgo genético para la enfermedad inflamatoria intestinal (EII) es muy diferente al de las personas con ascendencia europea, según los resultados del primer estudio del genoma completo de la EII en afroamericanos. Los autores dicen que la investigación clínica futura sobre la EII debe tener en cuenta la ascendencia.
Los hallazgos del estudio multicéntrico, que analizó los genomas completos de más de 1700 personas afectadas con enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa y más de 1600 controles, se publicaron el 17 de febrero en el American Journal of Human Genetics.
Como parte de su análisis, los investigadores desarrollaron un algoritmo que corrige la ascendencia al calcular una puntuación de riesgo poligénico de EII. Los puntajes de riesgo poligénico son herramientas para calcular el riesgo basado en genes para una enfermedad, que se utilizan para la EII y otras afecciones complejas, como la enfermedad de las arterias coronarias.
«Aunque el destino de la enfermedad parece el mismo, el las poblaciones se ven muy diferentes, en términos de qué genes específicos contribuyen al riesgo de EII», dice el autor principal Subra Kugathasan, MD. «Esto demuestra que no se puede desarrollar un puntaje de riesgo poligénico basado en una población y aplicarlo a otra».
Kugathasan es director científico del programa de EII pediátrica y director del Centro Infantil de Trasplantes e Inmunidad. humanos en Children’s Healthcare of Atlanta, así como profesor Marcus de pediatría y genética humana en la Facultad de Medicina de la Universidad de Emory.
El primer autor del artículo es el genetista Hari Somineni, Ph.D., quien obtuvo su doctorado trabajando con Kugathasan en Emory, y ahora trabaja en Goldfinch Bio en Massachusetts.
Los sitios principales para reclutar participantes del estudio fueron Emory, Cedars-Sinai y Rutgers, junto con Johns Hopkins y la Universidad de Washington en San Luis. Junto con Kugathasan, los coautores principales y coorganizadores del estudio fueron Steven Brant, MD de Rutgers y Dermot McGovern, MD, Ph.D. de Cedars-Sinai.
«Uno de nuestros objetivos en el tratamiento de la EII es avanzar hacia un enfoque más personalizado», dice McGovern, presidente de Joshua L. y Lisa Z. Greer en genética de enfermedades inflamatorias del intestino en Cedars -Sinaí. «Descifrar la arquitectura genética es una parte importante de este esfuerzo. Estudios como este son vitales para garantizar que las diversas poblaciones, incluidos los afroamericanos, se beneficien de los tremendos avances que promete la medicina genómica».
Tener un familiar de primer grado con una forma de EII confiere un riesgo mayor que cualquier factor ambiental conocido. Se piensa convencionalmente que los afroamericanos tienen menos riesgo de EII, pero Kugathasan dice que esa opinión puede reflejar disparidades en el diagnóstico y el acceso a la atención médica.
El estudio mostró que el locus de riesgo genético más importante para la EII en africanos AmericansPTGER4 es relativamente menor en las poblaciones de ascendencia europea, dice Kugathasan. Por el contrario, dos loci de genes que son principales en los europeos NOD2 e IL23R desempeñan papeles más pequeños en los afroamericanos.
Existe cierta superposición en los factores de riesgo genéticos basados en que la población afroamericana históricamente tiene alrededor del 20 por ciento de antecedentes genéticos europeos, con factores de riesgo de EII conocidos como IL23R provenientes del lado europeo.
En 2016, el equipo de investigación publicó el primer estudio de asociación del genoma completo de la EII en afroamericanos, identificando regiones del genoma asociadas con la colitis ulcerosa solo en personas de ascendencia africana.
Los estudios clínicos futuros de tratamientos para la EII deben tener en cuenta los antecedentes genéticos de poblaciones específicas, dice Kugathasan. Se están desarrollando varias terapias para la EII dirigidas a la vía del receptor IL23, en parte porque IL23R es un factor de riesgo genético importante, con poca atención al PTGER4. Eso tiene que cambiar, dice.
El estudio actual también identificó variantes genéticas raras que confieren riesgo de EII que son específicas de los afroamericanos, que no se habían observado en estudios anteriores. Las variantes están conectadas al gen que codifica la calbindina 2 (CALB2), una proteína involucrada en la señalización del sistema nervioso.
Lo que el estudio no encontró y decepcionó a los investigadores fue una serie de variantes genéticas raras que explican la «heredabilidad faltante». en la EII entre los afroamericanos. En los estudios de asociación de todo el genoma, la heredabilidad faltante se refiere al riesgo de enfermedad que no se explica por variantes genéticas comunes.
Para el futuro del campo de la EII, Kugathasan dice que los estudios de interacciones gen-ambiente que examinan factores como la dieta , el microbioma o las exposiciones tóxicas pueden arrojar información que los estudios de asociación del genoma completo no tienen.
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El estudio del genoma identifica genes de riesgo en afroamericanos con enfermedad inflamatoria intestinal Más información: Hari K. Somineni et al, Whole-genome sequencing of African Americans implica arquitectura genética diferencial en enfermedad inflamatoria intestinal, The American Journal of Human Genetics (2021). DOI: 10.1016/j.ajhg.2021.02.001 Información de la revista: American Journal of Human Genetics
Proporcionado por la Universidad de Emory Cita: Primer estudio de genoma completo múltiple of IBD in African Americans (2021, 19 de febrero) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-02-multi-whole-genome-ibd-african-americans.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.