Estudio basado en población revela fuertes vínculos genéticos con múltiples enfermedades y rasgos cardiometabólicos
Crédito: Colette Zylstra, Broad Communications
Científicos de Broad analizaron datos de secuenciación de más de 200 000 personas y encontraron variantes genéticas raras asociadas con enfermedades como diabetes e insuficiencia cardíaca .
El Biobanco del Reino Unido, una base de datos a gran escala de información genética y de salud de medio millón de participantes del Reino Unido, publicó nuevos datos el año pasado sobre las secuencias de la parte del genoma que codifica la proteína llamada exoma. Los investigadores que analizaron los datos de secuenciación del exoma completo de aproximadamente 200 000 participantes ahora han identificado varias nuevas variantes genéticas raras que aumentan en gran medida el riesgo de, o incluso causan, una variedad de enfermedades cardiometabólicas.
En un estudio publicado en Nature Genetics, investigadores del Broad Institute of MIT y Harvard, Geisinger MyCode Study, Regeneron Genetics Center y otras instituciones estudiaron la contribución de variantes genéticas raras a 83 enfermedades y rasgos cardiometabólicos diferentes, que incluyen insuficiencia cardíaca, diabetes, enfermedad renal y alta niveles de colesterol El equipo encontró 57 asociaciones significativas entre estas variantes y rasgos, algunos previamente conocidos y algunos descubiertos recientemente. También mostraron que del 1 al 2,4 por ciento de los participantes portan variantes genéticas vinculadas a ciertas enfermedades cardiometabólicas.
Los científicos dicen que los hallazgos demuestran el poder de la secuenciación a gran escala de todo el exoma y podrían ayudar a otras investigaciones dirigidas a encontrar nuevos tratamientos y métodos de detección para pacientes con estas enfermedades.
«Lo que fue fascinante para mí fue que pudimos detectar señales de estas enfermedades comunes y raras en 200,000 personas que son una muestra representativa del población», dijo Patrick Ellinor, coautor principal del estudio, director de la Iniciativa de Enfermedades Cardiovasculares y el Laboratorio de Cardiología de Precisión en el Instituto Broad, director del Centro Demoulas para Arritmias Cardíacas en el Hospital General de Massachusetts, y profesor de Harvard Medical Escuela.
Más allá de GWAS
Durante la última década, los estudios de asociación del genoma completo (GWAS) han identificado una gran cantidad de regiones genéticas asociadas con enfermedades, pero a menudo se centraron en variantes genéticas comunes con pequeñas Efectos sobre el riesgo de enfermedad. En lugar de analizar el genoma completo, el equipo se centró en las regiones codificantes de proteínas del genoma y, en particular, en variantes genéticas raras que desactivan un gen, también llamadas variantes de «pérdida de función» (LOF). Al concentrarse en estas variantes LOF, los investigadores pudieron identificar genes con un papel importante o incluso causal en enfermedades, lo que podría ayudar a los científicos a comprender mejor los mecanismos biológicos subyacentes a estas enfermedades.
Por ejemplo, el equipo encontró que las variantes raras del gen GIGYF1, que es uno de muchos otros genes previamente vinculados a la diabetes tipo 2, son responsables de un aumento importante en el riesgo de diabetes tipo 2.
El equipo también evaluó y aclaró la riesgo asociado con los genes mendelianos que se sabe que causan enfermedades. Por ejemplo, encontraron aumentos sorprendentes en el riesgo de colesterol alto en sangre y enfermedad renal crónica asociados con variantes en el gen LDLR y el gen PKD1, respectivamente. Con un conjunto de datos tan grande para analizar, el equipo también pudo evaluar con qué frecuencia se encontraron ciertas variantes raras de enfermedades cardiometabólicas en los participantes. Descubrieron que entre el 1 y el 2,4 por ciento de las personas eran portadoras de variantes potencialmente causantes de enfermedades como cardiomiopatía, arritmia, hipercolesterolemia y diabetes. Los científicos creen que este hallazgo puede ofrecer información sobre las frecuencias de las variantes patogénicas dentro de la población general.
Más allá del Reino Unido
Para replicar sus hallazgos en una población fuera del Reino Unido, el equipo de Broad trabajó con colaboradores del sistema de salud Geisinger y el Centro de Genética Regeneron para analizar datos de casi 175.000 participantes viviendo en los Estados Unidos. Encontraron una fuerte replicación de muchas de las asociaciones genéticas, lo que indica que los hallazgos no eran específicos de los datos del Biobanco del Reino Unido.
«Nuestros hallazgos pueden ayudar tanto a los genetistas como a los médicos a comprender mejor el riesgo relativo que confieren las enfermedades variantes», dijo Sean Jurgens, coautor y académico visitante de la Iniciativa de Enfermedades Cardiovasculares en Broad. «Nuestros hallazgos también pueden inspirar futuros estudios destinados a la detección genética de estas enfermedades cardiometabólicas».
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Genes de arritmia más comunes de lo que se pensaba Más información: Sean J. Jurgens et al, Análisis de la variación genética rara subyacente a las enfermedades y rasgos cardiometabólicos entre 200 000 individuos en el Biobanco del Reino Unido , Genética de la Naturaleza (2022). DOI: 10.1038/s41588-021-01011-w Información de la revista: Nature Genetics
Proporcionado por Broad Institute of MIT y Harvard Cita: Estudio basado en la población revela fuerte vínculos genéticos con múltiples enfermedades y rasgos cardiometabólicos (23 de febrero de 2022) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-02-population-based-reveals-strong-genetic-links.html Este documento está sujeto a los derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.