Estudio genómico identifica rutas de transmisión del coronavirus en hogares de ancianos
Crédito: Instituto Nacional del Cáncer
La vigilancia genómicautilizando información sobre diferencias genéticas entre muestras de virus puede ayudar a identificar cómo se propaga el SARS-CoV-2 en entornos de hogares de ancianos, cuyos residentes se encuentran en riesgo, según una nueva investigación publicada hoy.
Las residencias de ancianos tienen un alto riesgo de sufrir brotes de COVID-19, la enfermedad causada por el SARS-CoV-2. Las personas mayores y las personas afectadas por enfermedades cardíacas, respiratorias y diabetes tipo 2, que aumentan con la edad, tienen un mayor riesgo de enfermedad grave e incluso de muerte, lo que hace que la población de las residencias de mayores sea especialmente vulnerable.
Se sabe que las residencias de mayores ser entornos de alto riesgo de enfermedades infecciosas, debido a una combinación de la vulnerabilidad subyacente de los residentes que a menudo son frágiles y ancianos, el entorno de vida compartido con múltiples espacios comunes y la gran cantidad de contactos entre los residentes, el personal y los visitantes en un recinto cerrado space.
En una investigación publicada hoy en eLife, un equipo dirigido por científicos de la Universidad de Cambridge y el Instituto Wellcome Sanger utilizó una combinación de secuenciación del genoma e información epidemiológica detallada para examinar el impacto de COVID-19 en la atención. hogares y observar cómo se propaga el virus en estos entornos.
El SARS-CoV-2 es un virus de ARN y, como tal, su código genético es propenso a errores cada vez que se replica. Actualmente se estima que el virus muta a un ritmo de 2,5 nucleótidos (la A, C, G y U de su código genético) por mes. Leer o ‘secuenciar’ el código genético del virus puede proporcionar información valiosa sobre su biología y transmisión. Permite a los investigadores crear ‘árboles genealógicos’ conocidos como árboles filogenéticos que muestran cómo las muestras se relacionan entre sí.
Científicos y médicos en Cambridge han sido pioneros en el uso de la secuenciación del genoma y la información epidemiológica para rastrear brotes y redes de transmisión en hospitales y entornos de atención médica basados en la comunidad, ayudando a informar las medidas de control de infecciones y rompiendo las cadenas de transmisión. Desde marzo de 2020, han estado aplicando este método al SARS-CoV-2 como parte del Consorcio COVID-19 Genomics UK (COG-UK).
En este nuevo estudio, los investigadores analizaron muestras recolectadas de 6600 pacientes entre el 26 de febrero y el 10 de mayo de 2020 y analizados en el Laboratorio de Salud Pública de Inglaterra (PHE) en Cambridge. Del total de casos, 1.167 (18%) eran residentes de residencias de mayores de 337 residencias, de las cuales 193 eran residencias y 144 residencias de ancianos, la mayoría en el este de Inglaterra. La mediana de edad de los residentes de las residencias fue de 86 años.
Mientras que la mediana de casos por residencia fue de dos, las diez residencias con el mayor número de casos representaron 164 casos. Hubo una ligera tendencia a que los hogares de ancianos tuvieran más casos por hogar que los hogares residenciales, con una mediana de tres casos.
En comparación con los residentes de hogares que no son de cuidado ingresados en el hospital con COVID-19, los hogares de cuidado hospitalizados los residentes tenían menos probabilidades de ser admitidos en unidades de cuidados intensivos (menos del 7 % frente al 21 %) y más probabilidades de morir (47 % frente al 20 %).
Los investigadores también exploraron los vínculos entre los hogares de ancianos y los hospitales . El 68% de los residentes de residencias de ancianos ingresaron en el hospital durante el período de estudio. El 57 % ingresó con COVID-19, el 6 % de los casos tenía sospecha de infección adquirida en el hospital y el 33 % fue dado de alta del hospital dentro de los siete días posteriores a una prueba positiva. Estos hallazgos resaltan las amplias oportunidades para la transmisión del SARS-CoV-2 entre los hospitales y los hogares de ancianos.
Cuando los investigadores examinaron las secuencias virales, encontraron que en varios de los hogares de ancianos con la mayor cantidad de casos , todos los casos se agruparon muy juntos en un árbol filogenético con genomas idénticos o solo una diferencia de par de bases. Esto fue consistente con un solo brote que se propagó dentro del hogar de ancianos.
Por el contrario, para varios otros hogares de ancianos, los casos se distribuyeron a lo largo del árbol filogenético, con diferencias genéticas más generalizadas, lo que sugiere que cada uno de estos casos fue independientes y no relacionados con una fuente de transmisión compartida.
«Las personas mayores, en particular aquellas en hogares de ancianos que pueden ser frágiles, corren un riesgo particular de COVID-19, por lo que es esencial que hagamos todo lo posible para protéjalos», dijo el Dr. Este Trk, consultor honorario en Addenbrooke’s Hospital, Cambridge University Hospitals (CUH) y miembro visitante sénior honorario de la Universidad de Cambridge.
«Prevenir la introducción de nuevas infecciones a los hogares de ancianos debería ser una prioridad clave para limitar los brotes, junto con los esfuerzos de control de infecciones para limitar la transmisión dentro de los hogares de ancianos, incluso una vez que se haya identificado un brote».
El equipo encontró dos grupos que estaban vinculados a los trabajadores de la salud. . Uno de ellos involucró a residentes de la residencia, un cuidador de esa residencia y otro de una residencia desconocida, paramédicos y personas que convivían con ellos. El segundo involucró a varios residentes de hogares de ancianos y personal médico agudo en Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust que cuidaba al menos a uno de los residentes. No fue posible decir de dónde se originaron estos grupos y cómo se propagó el virus.
«Usar esta técnica de ‘vigilancia genómica’ puede ayudar a instituciones como residencias y hospitales a comprender mejor las redes de transmisión que permiten la propagación de COVID-19», agregó el Dr. William Hamilton de la Universidad de Cambridge y CUH. «Esto puede informar las medidas de control de infecciones, ayudando a garantizar que estos lugares sean lo más seguros posible para los residentes, pacientes, personal y visitantes».
El número absoluto de casos diagnosticados de COVID-19 de residentes de hogares de ancianos disminuyó más lentamente en abril que para los residentes que no son de hogares de cuidado, aumentando la proporción de casos de hogares de ancianos y contribuyendo a la lenta tasa de disminución en el número total de casos durante abril y principios de mayo de 2020.
«Nuestros datos sugieren que la transmisión en los hogares de ancianos fue más resistente a las medidas de confinamiento que los entornos que no son de hogares de ancianos. Esto puede reflejar la vulnerabilidad subyacente de la población de los hogares de ancianos y los desafíos de control de infecciones de cuidar a varios residentes que también pueden compartir espacios de vida comunales «, dijo Gerry Tonkin -Hill del Wellcome Sanger Institute.
El equipo no encontró nuevos linajes virales fuera del Reino Unido, lo que puede reflejar el éxito de las restricciones de viaje para limitar las nuevas introducciones virales en la población general durante durante la primera ola epidémica y el período de confinamiento.
Explore más
Siga las últimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) Más información: William L Hamilton et al. Epidemiología genómica de COVID-19 en hogares de ancianos en el este de Inglaterra, eLife (2021). DOI: 10.7554/eLife.64618 Información de la revista: eLife
Proporcionado por la Universidad de Cambridge Cita: Estudio de genómica identifica rutas de transmisión de coronavirus en hogares de ancianos (2021, 3 de marzo) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-03-genomics-routes-transmission-coronavirus-homes.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.