Genes que podrían explicar por qué algunos jóvenes sanos desarrollan síntomas graves de COVID-19
Fig. 1. Una estrategia analítica multiómica identifica vías y factores clave del Síndrome de Dificultad Respiratoria Aguda en COVID-19. (A) Cuarenta y siete pacientes críticos (C), 25 pacientes no críticos (NC) y 22 controles sanos (H) se inscribieron en el estudio. Las PBMC se aislaron mediante gradiente de densidad y se congelaron hasta su utilización para citometría de masas y proteómica completa. El plasma se usó para el perfilado de citocinas y la proteómica completa. El suero se utilizó para medir los anticuerpos neutralizantes anti-IFN tipo I, los anticuerpos neutralizantes anti-SARS-CoV-2 y la serología antiviral multidiana. Se usó sangre completa para la secuenciación de ARN-seq y del genoma completo (WGS). El número de muestras tratadas por grupo y por ómica se indica debajo de cada designación de ómica. (B) La canalización de RNA-seq se muestra en función de la comparación NC versus C. Para aumentar la solidez de los análisis posteriores, se aplicó un enfoque de inteligencia de conjunto con siete algoritmos a múltiples particiones de los datos de RNA-seq (ver Métodos) para clasificar a los pacientes NC versus C, realizando un análisis diferencial en cada partición de los datos. Luego se determinó una puntuación de clasificación de conjunto en seis de los siete algoritmos y todas las particiones de los datos, y los 600 genes principales se usaron como entrada para el modelado causal estructural para derivar una red causal putativa. Para respaldar los hallazgos clave de la primera cohorte de pacientes, se utilizaron datos de RNA-seq de una segunda cohorte de pacientes que consta de 81 pacientes críticos y 73 pacientes críticos recuperados. Los datos se dividieron de manera análoga a la primera cohorte de pacientes, pero solo se usaron las 600 características principales de la primera cohorte de pacientes para evaluar la capacidad informativa de la firma genética. (C) Se cuantificaron las citocinas y las células inmunitarias. Los datos de WGS se usaron para el análisis de eQTL junto con los recuentos de genes del RNA-seq. Los datos de proteómica se sometieron a análisis de expresión diferencial de proteínas y enriquecimiento de nGOseq. (D) Las vías y los impulsores clave resultantes de los análisis ómicos en (B y C) se validaron en una segunda cohorte de 81 pacientes críticos y 73 pacientes críticos recuperados. La expresión diferencial de ADAM9, el principal gen impulsor, se comparó con los datos de RNA-seq a granel disponibles públicamente. Finalmente, se realizaron experimentos de infección ex vivo con SARS-CoV-2 para validar un candidato a gen conductor. Crédito: DOI: 10.1126/scitranslmed.abj7521
Un equipo internacional de investigadores ha aislado cinco genes que son más activos en jóvenes con síntomas graves de COVID-19 que en aquellos con síntomas menos graves. En su artículo publicado en la revista Science Translational Medicine, el grupo describe su análisis genético de personas jóvenes infectadas sin factores contribuyentes conocidos para la enfermedad.
Algunos jóvenes sanos, a pesar de no tener condiciones subyacentes aparentes, aún desarrollan síntomas muy graves de COVID. Por qué sucede esto sigue siendo un misterio. En este nuevo esfuerzo, los investigadores encontraron posibles genes clave que parecen reducir la capacidad del cuerpo para combatir la enfermedad cuando se activan.
El trabajo consistió en recolectar muestras de plasma de 72 pacientes jóvenes hospitalizados con COVID, 47 de los cuales eran críticamente enfermo. Ninguno de los muestreados tenía condiciones subyacentes que pudieran explicar sus síntomas. El equipo también recolectó muestras de 22 jóvenes infectados que tenían pocos o ningún síntoma para servir como grupo de control. Los investigadores notaron desde el principio que los pacientes que estaban más enfermos también sufrían de un aumento de la inflamación y la coagulación. Luego realizaron la secuenciación del genoma completo en las muestras, junto con la secuenciación del ARN, la proteómica celular, el perfil de citoquinas y la inmunofenotipificación. También utilizaron una aplicación de aprendizaje automático para detectar patrones en los genes. Su análisis reveló cinco genes que eran más activos en los pacientes con síntomas graves. Uno, ADAM9, resultó ser el más prevalente.
El equipo descubrió que cuando se bloqueaba ADAM9 en tejido pulmonar humano in vitro, el virus era menos eficaz para duplicarse. Los investigadores sugieren que los cinco genes que identificaron deben estudiarse más a fondo, en particular ADAM9. Hacerlo podría conducir a terapias para desactivar la actividad de dichos genes y, al hacerlo, reducir los síntomas de COVID-19.
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La mitad de los adultos jóvenes con COVID-19 tienen síntomas persistentes después de 6 meses Más información: Raphael Carapito et al, Identificación de genes impulsores de formas críticas de COVID-19 en una cohorte de pacientes jóvenes profundamente fenotipados, Science Translational Medicine (2021). DOI: 10.1126/scitranslmed.abj7521 Información de la revista: Science Translational Medicine
2021 Science X Network
Cita: Genes que podrían explicar por qué algunos los jóvenes saludables desarrollan síntomas graves de COVID-19 (2021, 1 de noviembre) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-11-genes-healthy-young-people-severe.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.