Investigadores trabajan en modelos computacionales para diseñar formas de tratar el COVID-19

Esta imagen muestra cómo la proteína «espiga» del virus que causa el COVID-19 se une a una proteína receptora en la superficie de las células que recubren el sistema respiratorio humano ( membrana celular mostrada en verde y rojo en la parte inferior). Comprender cómo la espiga (hecha de tres proteínas, roja, amarilla y azul) se une al receptor (enzima convertidora de angiotensina 2, o ACE2, púrpura) y modelar cómo las diferentes moléculas podrían interferir con esta interacción podría ayudar a los científicos a desarrollar antivirales. drogas Crédito: Profesor de la SBU Carlos Simmerling y estudiante de posgrado de la SBU Lucy Fallon

Un equipo de investigadores de la Universidad de Stony Brook (SBU) está trabajando en modelos informáticos que podrían ayudar a acelerar el descubrimiento de medicamentos para combatir el nuevo coronavirus responsable de la COVID-19. Están haciendo este trabajo en colaboración con científicos del Laboratorio Nacional Brookhaven y el Laboratorio Nacional Argonne del Departamento de Energía de EE. UU. (DOE), y aprovecharán los recursos computacionales y la experiencia de esos laboratorios.

Los investigadores, dirigidos por Carlos Simmerling, profesor de biología física y cuantitativa de Marsha Laufer, profesor de química y director asociado del Centro Laufer en SBU, están trabajando en modelos para comprender mejor cómo la proteína «espiga» en la superficie de el virus COVID-19 interactúa con las células que infecta.

Estos picos alrededor del exterior de las partículas esféricas del virus le dan al virus el aspecto de una corona y su nombre como coronavirus. También son la parte del virus que se adhiere a una célula dentro del sistema respiratorio de las personas, utilizando una proteína específica en la célula humana para comenzar el proceso de causar infección. Debido a esta función, la proteína espiga también es el objetivo principal de los anticuerpos que brindarían inmunidad al coronavirus y para desarrollar medicamentos que potencialmente podrían bloquear la infección.

Simmerling y sus colegas están utilizando modelos informáticos para comprender más sobre cómo funciona el pico.

Los científicos ya han capturado «imágenes» útiles del pico con detalles a nivel atómico, y tienen una buena idea de lo que está haciendo el pico. Por ejemplo, saben que la espiga cambia de forma a medida que entra en contacto con la célula, y esto lleva a que el virus y la célula se fusionen. Pero necesitan conocer más detalles para controlarlo.

Un equipo de investigadores de la Universidad de Stony Brook está trabajando en modelos informáticos que podrían ayudar a acelerar el descubrimiento de fármacos para combatir el nuevo coronavirus responsable de la COVID-19. Están haciendo este trabajo en colaboración con científicos del Laboratorio Nacional Brookhaven y el Laboratorio Nacional Argonne del Departamento de Energía de EE. UU. (DOE), y aprovecharán los recursos computacionales y la experiencia de esos laboratorios. Crédito: Laboratorio Nacional de Brookhaven , realmente no sabes cómo funciona», dijo Simmerling. «Probablemente tampoco adivinarías que la manija es la parte que necesitas mover para que la puerta se abra, y que tal vez haya una llave que pueda bloquearla y evitar que se abra.

» Con nuestra investigación y modelado por computadora, estamos trabajando para comprender el proceso a ese nivel más detallado», explicó. «Por ejemplo, ¿qué lleva exactamente al pico del virus que abre la ‘puerta’ a la infección cuando entra en contacto con la célula? Y, ¿hay lugares en la espiga lejos de este punto de contacto que podrían actuar como llaves, donde los científicos podrían hacer una pequeña molécula que se uniría a ella y la cerraría?»

Como Kerstin Kleese van Dam, director de la Iniciativa de Ciencias Computacionales de Brookhaven Lab, señaló: «Examinaremos 60 sitios objetivo diferentes donde un nuevo fármaco puede adherirse al virus y 1.000 millones de moléculas similares a fármacos que podrían usarse para modificar las ‘manijas de las puertas’, ‘bisagras’ u otros componentes para que podamos identificar las opciones más prometedoras para neutralizar el virus y evitar que entre en las células».

Los modelos informáticos desarrollados en colaboración con científicos informáticos de Brookhaven y Argonnesoon para ser ampliado para ejecutarse en supercomputadoras en estos laboratorios ayudará a clasificar los detalles de estas interacciones virus-célula para ayudar a desbloquear una comprensión de la proteína del pico del virus COVID-19.

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Siga las últimas noticias sobre el coronavirus (Brote de COVID-19 Proporcionado por Brookhaven National Laboratory Cita: Investigadores que trabajan en modelos computacionales para diseñar formas de tratar COVID-19 (2020, 7 de abril) recuperado el 31 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2020- 04-ways-covid-.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.