Los científicos secuencian más de 1000 genomas de COVID-19 para ayudar en la respuesta a la pandemia
Crédito: Universidad de Sheffield
Ahora se han producido más de 1000 secuencias del genoma del coronavirus como parte del trabajo realizado por científicos y médicos de la Universidad de Sheffield y Fideicomiso de la Fundación del Servicio Nacional de Salud de los Hospitales Docentes de Sheffield.
Los datos son un hito importante para su trabajo como parte de un consorcio del Reino Unido para mapear cómo se propaga, se comporta y muta el COVID-19. Se publicará en su totalidad en una base de datos pública utilizada por investigadores y científicos que trabajan en soluciones para el brote de coronavirus en todo el mundo.
Con el respaldo del gobierno del Reino Unido, la inversión de 20 millones permitió que grupos de expertos de todo el Reino Unido trabajaran juntos para analizar rápidamente el código genético de las muestras de coronavirus que circulan en el Reino Unido. El trabajo está creando inteligencia para compartir con agencias de salud pública, hospitales, centros regionales del NHS y el gobierno para ayudar a combatir el virus.
Al mapear el genoma de COVID-19, los científicos pueden monitorear los cambios en el virus en a escala nacional y global, mejorando la comprensión de cómo se está propagando y mutando, informando la atención clínica de los pacientes e incluso salvando vidas.
El Consorcio COVID-19 Genomics UK incluye el NHS, las agencias de salud pública, el Instituto Wellcome Sanger, y numerosas instituciones académicas, incluida la Universidad de Sheffield.
Dr. Asíhan de Silva, profesor clínico sénior y médico consultor honorario en enfermedades infecciosas de la Universidad de Sheffield, dirige el grupo colaborativo de genómica COVID-19 de Sheffield. Los miembros incluyen especialistas del Instituto Florey para Interacciones entre Patógenos y Huéspedes de la Universidad, el Instituto Sheffield de Neurociencia Traslacional (SITraN), el Departamento de Ciencias Animales y Vegetales, el Departamento de Biología Molecular y Biotecnología y el Departamento de Ciencias de la Computación.
Dr. . Matthew Parker y el Dr. Dennis Wang han estado dirigiendo el análisis bioinformático para el proyecto en el Centro de Investigación Biomédica de Sheffield del Instituto Nacional de Investigación en Salud (NIHR) y el Departamento de Ciencias de la Computación.
Dr. Parker dijo: «Utilizando la experiencia en Sheffield Bioinformatics Core, hemos construido una tubería sólida que toma los datos genómicos de los casos virales en nuestra región y los compara con los de todo el mundo para identificar nuevas mutaciones. Al colaborar con nuestro nacional e internacional socios, podremos rastrear la propagación del virus y las instalaciones y la experiencia que tenemos aquí en Sheffield son clave para un proyecto exitoso como este.
«Nuestro equipo de colaboración ha ampliado rápidamente su capacidad y ha formulado nuevos procesos para poder secuenciar genomas a una escala que no hemos hecho antes. El personal del laboratorio ahora está secuenciando genomas de muestras tomadas de pacientes con casos confirmados de COVID-19 a un ritmo de más de 100 por semana».
El Dr. de Silva dijo: «Al observar el genoma completo del virus en personas que han tenido casos confirmados de coronavirus, podemos monitorear los cambios en el virus a escala nacional y global para comprender cómo se está propagando.
«El trabajo está ayudando a coordinar respuestas ágiles a nuevas enfermedades infecciosas a medida que se propagan y mutan en las poblaciones locales. Esto es fundamental para que la comunidad de investigación en salud pueda contribuir a nuestra comprensión de los brotes de nuevas enfermedades infecciosas, informando sobre la atención clínica de los pacientes e incluso salvando vidas».
El equipo está trabajando en asociación con los virólogos consultores, el Dr. Cariad Evans, el Dr. Mohammad Raza, la Dra. Alison Cope y el microbiólogo consultor Dr. Dave Partridge, del laboratorio regional de virología del NHS de Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust con sede en el Northern General Hospit. Alabama; para responder al brote del virus que evoluciona rápidamente en la región de Yorkshire.
Dr. Cariad Evans dijo: «Tenemos expertos nacionales e internacionales en virología trabajando en nuestros laboratorios y estamos muy orgullosos de participar en este importante trabajo para determinar cómo se comporta este nuevo virus y cómo ese conocimiento podría informar la atención o el tratamiento en el futuro».
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Siga las últimas noticias sobre el brote de coronavirus (COVID-19) Más información: Se puede acceder a la base de datos del COG Consortium en www.cogconsortium.uk/data/ Proporcionada por Cita de la Universidad de Sheffield: Los científicos secuencian más de 1000 genomas de COVID-19 para ayudar en la respuesta a la pandemia (15 de mayo de 2020) consultado el 31 de agosto de 2022 en https://medicalxpress.com/news/2020-05- cientificos-secuencia-covid-genomas-ayuda.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.