Nueva tecnología de biopsia para el análisis de múltiples biomarcadores de tejido tumoral

Fig. 1: Esquema del enfoque MOSAICA para el etiquetado y análisis de componentes espectrales y de resolución temporal. una Muestra(s) puede(n) ser células o tejidos fijados. Los transcritos de ARN de los genes de interés son el objetivo de la detección. Los objetivos de proteínas también se pueden teñir en la codetección de ARNm y proteínas. b Las sondas de marcación primaria están diseñadas para incluir dos regiones funcionales: una región objetivo que es complementaria y puede unirse al objetivo de ARNm y una región de lectura adyacente que posteriormente puede unirse a oligonucleótidos marcados con fluorescencia. c Se agregan sondas fluorescentes secundarias para unirse a las sondas primarias para formar diferentes combinaciones (marcaje combinatorio) a través de un dominio de lectura. d Los objetivos marcados se miden bajo un microscopio fluorescente para interrogar las características espectrales y de vida útil de los restos marcados. El análisis fasorial se utiliza para identificar qué etiquetas de fluoróforo están presentes en cada píxel y punto. f Los objetivos etiquetados que provocan la firma codificada basada en la intensidad y el tiempo se decodifican para revelar las ubicaciones, identidades, recuentos y distribuciones de los objetivos de ARNm presentes de forma multiplexada. Crédito: DOI: 10.1038/s41467-021-27798-0

Un equipo dirigido por investigadores de la Universidad de California en Irvine ha desarrollado una nueva tecnología de biopsia que puede perfilar múltiples biomarcadores del microambiente tumoral simultáneamente, revelando la organización espacial celular y las interacciones que ayudarán avanzar en el diagnóstico y tratamiento personalizado de enfermedades. Las biopsias actuales de un solo biomarcador carecen de la capacidad de analizar muchos marcadores diferentes y, a menudo, no logran predecir los resultados de los pacientes.

Denominado ensayo multiómico de escaneo único con análisis combinatorio integrado, la tecnología basada en imágenes de fluorescencia puede perfilar espacialmente una gran cantidad de marcadores de proteínas y ARNm en células y tejidos, incluidos los tejidos tumorales clínicos. Un estudio publicado hoy en Nature Communications muestra que MOSAICA permite la creación de perfiles de biomarcadores directos y altamente multiplexados en un contexto espacial 3D utilizando una sola ronda de tinción e imágenes en lugar de los pasos de procesamiento repetidos que normalmente se necesitan en los métodos convencionales.

Médicos y los científicos ahora tendrán una visión holística de los diferentes tipos de células inmunes y cancerosas en los tejidos tumorales, lo que brindará una mayor comprensión para determinar el pronóstico y el tratamiento del paciente.

«La biología espacial es una nueva frontera científica y mapear cada célula y su función en el cuerpo tanto a nivel molecular como tisular es fundamental para comprender la enfermedad y desarrollar diagnósticos y tratamientos de precisión», dijo Weian Zhao, Ph.D., profesor de ciencias farmacéuticas de la UCI y coautor del estudio. «Muchos inmunoterapéuticos contra el cáncer, incluidos los inhibidores de puntos de control inmunitarios, no funcionan y los científicos se dieron cuenta de que se debía a la organización espacial de todos los tipos de células de tejido tumoral, lo que determina la eficacia del fármaco. El MOSAICA puede caracterizar las composiciones celulares espaciales y las interacciones en el tumor. microambiente inmunitario en biopsias para informar el diagnóstico y el tratamiento personalizados».

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El análisis espacial de una sola célula puede ayudar a predecir la respuesta a la inmunoterapia neoadyuvante en el cáncer de mama triple negativo. codificación, imágenes y análisis, Nature Communications (2022). DOI: 10.1038/s41467-021-27798-0 Información de la revista: Nature Communications

Proporcionado por la Universidad de California, Irvine Cita: Nueva tecnología de biopsia para analizar tumores múltiples biomarcadores de tejido (2022, 11 de enero) recuperado el 29 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2022-01-biopsy-technology-multiple-tumor-tissue.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.