Nuevo estudio apunta a mejores diagnósticos para el cáncer

Los gráficos de dispersión muestran la correlación entre la expresión diferencial y la metilación diferencial calculada por los métodos tradicional y CHALM. Crédito: Facultad de Medicina de la UCI

Un nuevo estudio dirigido por la Universidad de California en Irvine encuentra que un nuevo método para identificar biomarcadores puede ayudar en el diagnóstico temprano del cáncer. El estudio se centró en el cáncer de pulmón; sin embargo, el método de metilación cLonal ajustada por heterogeneidad celular (CHALM) también se probó en el envejecimiento y las enfermedades de Alzheimer y se espera que sea eficaz para estudiar otras enfermedades.

«Descubrimos que el método CHALM puede ser una herramienta valiosa para ayudar a los investigadores a identificar genes diferencialmente metilados más confiables a partir de datos de metilación basados en secuencias», dijo Wei Li, Ph.D., presidente de Grace B. Bell y profesor de bioinformática en el Departamento de Química Biológica de la Facultad de Medicina de la UCI. «Para los médicos, este método puede ayudar en el diagnóstico del cáncer al ayudarlos a identificar biomarcadores más útiles, que el método tradicional pasa por alto».

Publicado en Nature Communications, el estudio, titulado «Cellular Heterogeneity-Adjusted La metilación cLonal (CHALM) mejora la predicción de la expresión génica», ilustra la importancia de tener en cuenta la heterogeneidad celular al calcular el nivel de metilación del ADN a partir de datos de secuenciación.

«Después de aplicar nuestro método CHALM a un conjunto de datos de cáncer de pulmón, capaz de identificar genes diferencialmente metilados más confiables y relacionados con funciones biológicas. La aplicación de nuestro método CHALM puede conducir a una mejor detección temprana del cáncer», dijo Li.

Usando métodos tradicionales para identificar biomarcadores de cáncer, los investigadores han encontrado constantemente la la correlación entre la expresión génica y la metilación del promotor es débil, especialmente para genes poco metilados. Este nuevo estudio encontró que el método CHALM permitió una identificación más confiable de marcadores metilados que no pueden detectarse con métodos tradicionales.

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Los biomarcadores de la metilación del ADN pueden predecir el riesgo de cáncer de mama Más información: Jianfeng Xu et al, Cellular HeterogeneityAdjusted cLonal Methylation (CHALM) mejora la predicción de la expresión génica, Nature Comunicaciones (2021). DOI: 10.1038/s41467-020-20492-7 Información de la revista: Nature Communications

Proporcionado por la Universidad de California, Irvine Cita: Nuevo estudio apunta a mejores diagnósticos para cancer (2021, 27 de enero) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-01-diagnostics-cancer.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.