Respuesta a la terapia de infecciones mejor entendida gracias a una nueva técnica
Crédito: CC0 Public Domain
Las enfermedades infecciosas son causadas por virus, bacterias, hongos o parásitos patógenos. El tratamiento de infecciones bacterianas y fúngicas se basa particularmente en medicamentos antimicrobianos, mientras que el enfoque en el tratamiento de infecciones virales es el alivio de los síntomas.
La terapia inicial para la infección a menudo es empírica y está guiada por la presentación clínica. Sin embargo, rara vez se comprende su eficacia sobre el patógeno al inicio del tratamiento. Aunque existen métodos para evaluar las respuestas al tratamiento, la eficacia se determina principalmente mediante el control de los síntomas y signos de infecciones.
Los avances en la tecnología de secuenciación han hecho que la caracterización de los genomas y los productos de expresión génica sean cada vez más prácticos. La tecnología también ha hecho posible identificar los componentes de la microbiota hasta el nivel de especie y de gen. No obstante, la secuenciación de la microbiota solo se emplea ocasionalmente en el tratamiento de infecciones.
Ahora, investigadores de la Universidad de Helsinki, junto con sus colaboradores del Hospital Universitario de Helsinki, han desarrollado un nuevo enfoque basado en la secuenciación para el descubrimiento de patógenos a partir de muestras desafiantes. El enfoque y los resultados preliminares sobre su uso en la evaluación de eliminación de infecciones de heridas por quemaduras se publicaron en la revista Clinical Microbiology and Infection.
«El enfoque permite capturar las actividades funcionales en tiempo real incluso de cantidades minúsculas de microbios «Se puede utilizar para investigar de forma fiable la actividad de los mecanismos microbianos de resistencia a los medicamentos y otros mecanismos microbianos relevantes para la infección o su tratamiento. Esto ayuda a comprender si los microbios causales están vivos o muriendo y qué hacen», dice el bioinformático Matti Kankainen, Ph. D., de la Universidad de Helsinki.
La técnica arroja luz sobre las actividades de los patógenos
El principio subyacente de la técnica es el siguiente: se toma una muestra clínica del paciente y su ARN , la base subyacente de los procesos biológicos, se extrae. A continuación, el ARN microbiano se enriquece para ampliar la información del patógeno. El ARN se secuencia y la gran cantidad de datos obtenidos se analiza mediante algoritmos novedosos.
Para comprender el valor del enfoque en la práctica clínica, los investigadores aplicaron su solución a un caso complicado de infección de heridas. El sujeto de estudio era un paciente con infección de herida que había sido tratado con varias terapias con antibióticos durante casi cien días sin éxito. A pesar de las terapias, la infección reapareció. Poco después del inicio del cuarto régimen de antibióticos, los investigadores recolectaron muestras del sitio de la infección. Las muestras se analizaron utilizando su enfoque, así como con la ayuda del perfilado del gen de ADN 16S más común. Las muestras correspondientes también se recolectaron de un sujeto de control.
El cuarto régimen de antibióticos demostró ser efectivo y alivió los síntomas. Los resultados obtenidos con el nuevo enfoque coincidieron con la presentación clínica y confirmaron la eliminación del patógeno. Además, demostraron la recuperación de la microbiota normal. No se observó un cambio similar en la microbiota en el perfil 16S. En cambio, se identificaron patógenos candidatos de la infección, debido a la lenta descomposición del ADN.
La metatranscriptómica puede ser la respuesta para diagnosticar enfermedades infecciosas
El enfoque utilizado se conoce como metatranscriptómica. Permite la determinación integral de la actividad génica microbiana. Su uso se ha vuelto cada vez más frecuente, pero los problemas relacionados con la manipulación y el análisis de muestras de microbios huéspedes desafiantes han impedido el uso clínico más generalizado de la metatranscriptómica.
«Nuestros hallazgos demuestran que nuestra solución se adapta también a muestras desafiantes que contienen cantidades
minúsculas de microbios. Además de la identificación de patógenos, se puede usar para caracterizar la interacción huésped-microbio. Por lo tanto, puede arrojar luz sobre mecanismos de enfermedades aún no identificados. Desarrollaremos la técnica aún más como parte de la infección. estudios en curso en nuestro laboratorio. El trabajo adicional también se centrará en comprender su espectro de aplicación «, dice Esko Kankuri, docente en farmacología en la Universidad de Helsinki.
El investigador postdoctoral Teija Ojala de la Universidad de Helsinki desarrolló el nuevo Acercarse. A continuación, Ojala utilizará la técnica para avanzar en la comprensión de la enfermedad por coronavirus COVID-19.
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Los científicos arrojan nueva luz sobre cómo las bacterias pulmonares se defienden de la neumonía Más información: Teija Ojala et al. Evaluación metatranscriptómica de la eliminación de infecciones por quemaduras, Microbiología clínica e infecciones (2020). DOI: 10.1016/j.cmi.2020.07.021 Proporcionado por la Universidad de Helsinki Cita: Respuesta a la terapia de infección mejor entendida gracias a una nueva técnica (2021, 7 de enero) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https:/ /medicalxpress.com/news/2021-01-response-infection-therapy-understood-technique.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.