Una nueva prueba genética simplificada detecta eficazmente los cánceres hereditarios
Crédito: Pixabay/CC0 Dominio público
Los investigadores han desarrollado un nuevo protocolo de secuenciación de ADN genético/epigenético integrado conocido como MultiMMR que puede identificar la presencia y la causa de la reparación de errores de coincidencia ( MMR) en una sola prueba de una pequeña muestra de ADN en cáncer de colon, endometrio y otros. Esta alternativa a los complejos flujos de trabajo de pruebas de varios pasos también puede determinar las causas de la deficiencia de MMR que a menudo se pasan por alto en las pruebas clínicas actuales. Sus resultados se presentan en el Journal of Molecular Diagnostics.
Los genes MMR monitorean y reparan los errores que pueden ocurrir en la replicación y recombinación celular normal. En algunos cánceres hereditarios y adquiridos, uno o más de los genes MMR están desactivados. «El impacto de MultiMMR es amplio. Los tumores con deficiencia de MMR responden bien a las nuevas inmunoterapias contra el cáncer», explica el investigador principal Trevor J. Pugh, Ph.D., Departamento de Biofísica Médica de la Universidad de Toronto; Centro de Cáncer Princess Margaret, Red de Salud Universitaria; y el Instituto de Ontario para la Investigación del Cáncer, Toronto, ON, Canadá. «Determinar si una persona tiene una forma hereditaria de deficiencia de MMR también puede permitir a los médicos inscribir a los pacientes en vigilancia activa, participar en estrategias de reducción de riesgos y proporcionar pruebas genéticas a los familiares, lo que podría mejorar los resultados de los pacientes».
Clínico estándar las pruebas para la deficiencia de MMR pueden ser inconsistentes, requiriendo múltiples pruebas y tipos de experiencia, lo que resulta en una atención subóptima para los pacientes. Las pruebas de secuenciación de próxima generación han ganado popularidad y se están utilizando en laboratorios clínicos. Sin embargo, no identifican todas las variaciones genéticas para la deficiencia de MMR y, a menudo, se requieren pruebas adicionales.
El MultiMMR analiza simultáneamente la metilación del promotor, las mutaciones, el estado del número de copias, la pérdida de heterocigosidad de copia neutral y la inestabilidad de microsatélites. de una pequeña cantidad de ADN. En este estudio, los investigadores secuenciaron el ADN de 142 especímenes (82 muestras normales y 60 tumorales) de 82 pacientes con cáncer colorrectal, endometrial y cerebral asociado con MMR. Como control positivo, los resultados de 45 pacientes se compararon con pruebas clínicas anteriores utilizando ensayos convencionales. También utilizaron MultiMMR para perfilar un control de ADN comercialmente disponible que incluye 11 variantes que son difíciles de detectar con la secuenciación de próxima generación.
Para detectar la presencia de deficiencia de MMR, la metilación del promotor MultiMMR y los análisis de inestabilidad de microsatélites encontraron 95 por ciento y 97 por ciento de concordancia con las pruebas clínicas, respectivamente. Al detectar variantes responsables de la deficiencia de MMR, MultiMMR coincidió con los resultados de las pruebas clínicas en 23 de 24 casos. La prueba identificó las 11 mutaciones en la mezcla sintética en múltiples corridas de secuenciación e identificó la deficiencia de reparación de errores de emparejamiento en 29 pacientes con pruebas incompletas o no concluyentes. El panel pudo identificar las causas de MMR que a menudo se pasan por alto en la cascada clínica actual.
«Hemos demostrado que la presencia y la causa de MMR se pueden determinar en una sola prueba, a partir de una sola alícuota de ADN, haciendo así el mejor uso del tejido disponible, agilizando los flujos de trabajo y mejorando los informes integrados para Lynch y los cánceres hereditarios relacionados», comenta la autora principal Leslie Oldfield, MSc, Departamento de Biofísica Médica, Universidad de Toronto; y Princess Margaret Cancer Centre, University Health Network, Toronto, ON, Canadá.
Los investigadores señalan que es posible que los protocolos de pruebas en cascada actuales no puedan satisfacer la mayor demanda de pruebas tumorales universales en pacientes con cáncer colorrectal y de endometrio. . Muchas pruebas de secuenciación de próxima generación no detectan la inestabilidad de microsatélites y la metilación del promotor junto con mutaciones somáticas, por ejemplo.
«La elegibilidad para la inmunoterapia a menudo depende del estado de MMR, por lo que es importante realizar pruebas oportunas y sólidas», agrega Sra. Oldfield. «MultiMMR agiliza el proceso y distingue el tipo de deficiencia de MMR con un tiempo de respuesta mejorado, puede escalar bien con demandas crecientes y puede proporcionar a los médicos información importante para informar el manejo del paciente y las decisiones de tratamiento».
Explore más
Nuevo tipo de cáncer con mutaciones PIK3CA Más información: Leslie E. Oldfield et al, An Integrative DNA Sequencing and Methylation Panel to Assess Mismatch Repair Deficiency, The Journal of Molecular Diagnostics (2020). DOI: 10.1016/j.jmoldx.2020.11.006 Información de la revista: Journal of Molecular Diagnostics
Proporcionado por Elsevier Cita: Nueva prueba genética simplificada detecta eficazmente la cancers (2021, 21 de enero) recuperado el 30 de agosto de 2022 de https://medicalxpress.com/news/2021-01-genetic-effectly-screens-hereditary-cancers.html Este documento está sujeto a derechos de autor. Aparte de cualquier trato justo con fines de estudio o investigación privados, ninguna parte puede reproducirse sin el permiso por escrito. El contenido se proporciona únicamente con fines informativos.